A obesidade infantil e em adolescentes representa um problema de saúde pública, com domínio global. Sabe-se que ações que promovam a prática de atividade física na infância, em idade escolar, são relevantes, devido ao reconhecido efeito desta sobre a redução do risco cardiovascular em crianças e na obesidade infantil. Nesse contexto, o objetivo deste estudo foi analisar os efeitos do método Pilates sobre variáveis de composição corporal em crianças, conforme o estado nutricional. Esse estudo incluiu escolares de ambos os sexos (7 e 8 anos). A composição corporal foi avaliada, pré e pós-intervenção, através das mensurações de massa corporal e estatura (para o cálculo do Índice de Massa Corporal: IMC), circunferência da cintura (CC) e do quadril, para os cálculos da relação cintura quadril (RCQ), e relação cintura estatura (RCE). Os escolares foram estratificados em dois grupos, conforme o estado nutricional: grupo saudável e grupo de risco para sobrepeso e obesidade. As crianças praticaram o método Pilates ao longo de 12 semanas. Quanto aos resultados, no grupo saudável, houve uma redução significativa da CC (p=0,020), RCQ (p=0,005) e RCE (p=0,001) pós-intervenção. Já no grupo das crianças de risco, houve manutenção destas variáveis após o método Pilates. Em conclusão, a prática do método Pilates apresentou efeitos positivos sobre as variáveis de adiposidade corporal em crianças com peso corporal normal. Contudo, foi insuficiente para modificar tais variáveis nas crianças de risco, o que indica a necessidade da inserção de outras modalidades de exercícios para modificar o padrão de composição corporal nessas crianças.